La sécheresse et les très fortes chaleurs affectent les cours d’eau. Les débits diminuent et la température de l'eau augmente, ce qui fragilise les poissons qui manquent d'oxygène. Des centaines de poissons ont ainsi été retrouvés morts dans le canal de Bruxelles (>). En Suisse, la pêche est désormais interdite sur certains tronçons (>). Pour l'instant, de telles mesures n'ont pas été prises en France mais les fédérations suivent de près l'évolution de la situation et pratiquent des pêches de sauvetage pour emmener les poissons dans des eaux plus profondes, par exemple en Dordogne (>), dans les Vosges (>) ou en Alsace.